La Confederació Hidrogràfica de l'Ebre (CHE) està executant el tancament d'accessos no autoritzats i incontrolats per a embarcacions als embassaments navegables de la conca. Aquesta mesura, inclosa al pla de xoc contra el musclo zebra, permetrà un millor control de la navegació i del compliment dels protocols de desinfecció d'embarcacions, reduint el risc de contagi de masses d'aigua. L'organisme de conca ha inventariat els punts d'accés que no tenen control als 57 embassaments navegables. De moment, ja s'han clausurat 18 al País Basc.
Un dels factors principals d'expansió de les larves del musclo zebra és l'ús d'embarcacions, sobretot per a pesca esportiva. Per això, la navegació en aigües fluvials compta des del 2007 amb una nova normativa aprovada per la CHE que estableix una sèrie de protocols i restriccions amb l'objectiu de reduir al màxim el trasllat de larves o d'adults d'uns embassaments a altres. Amb el tancament d'accessos no controlats, s'aconseguirà que els usuaris compleixin amb els protocols de desinfecció ja que les embarcacions entraran pels punts coneguts que ja compten amb estacions de neteja. La CHE preveu que el tancament d'aquests punts es faci durant aquest any.Les estacions de desinfecció pel musclo zebra poden construir-se per iniciativa privada o de qualsevol administració, i la seva gestió pot ser privada. Durant el passat 2009, la CHE va projectar fins a vint noves estacions. De moment, s'han executat les de l'Estanca d'Alcanyís i l'embassament d'Alloz. Durant aquest 2010, està previst que s'acabin les dels embassaments de l'Ebro, Sobrón, El Grado, Mediano, la Sotonera, Calanda, i Santolea. A més, també està previst a Riba-roja (Ribera d'Ebre), Mequinensa (Baix Cinca), Talarn (Pallars Jussà) i Flix (Ribera d'Ebre). A aquestes estacions caldrà sumar les que ja va construir la CHE anteriorment a l'embassament del Ebro a Cantàbria, de Ullívarri al País Basc, i a Mequinensa, al càmping de Casp-Saragossa.